1962年東京都生まれ。
高校卒業後アニメーターに憧れ、東京芸術大学美術学部日本画科に入学。91年に個展「TAKASHI,TAMIYA」で現代美術家としてデビュー。93年同大学院美術研究科日本画専攻初となる博士号取得し、94年にはP.S.1 ART PROJECTの助成金を受けニューヨークに滞在。アニメ、フィギュアなどいわゆるサブカルチャーであるオタク系の題材を用いた作品で知られ、六本木ヒルズやルイ・ヴィトン、ゆずなどとのコラボレーション、テレビやCMへの出演など多彩に活躍。自らの作品制作を行うかたわら、芸術イベント「GEISAI」を主催、アーティスト集団「カイカイキキ」を主宰し、若手アーティストのプロデュースを行う。2008年にはTime誌の「世界で最も影響力のある100人」に選ばれた。著書に『芸術起業論』（幻冬舎）がある。

美少女フィギュア『HIROPON』が約4,890万円で落札とか、精液を放出する青年フィギュア『My Lonesome CowBoy』は約16億円で落札とか、村上作品には常にお金の話がつきまとう。欧米の優越性に挑戦した"スーパーフラット"という概念が海外で評価される一方、日本では「日本文化を切り売りする金儲け主義」などと嫌われるのは、なんという皮肉。日本人が村上批判をしている間に、中国や韓国やインドなどが、経済力と文化的インフラを整えているというのに。立ち止まらないでくださ〜い（美術館監視員風にどうぞ）。

2004年　コンパニヨン・デュ・ボージョレー騎士号授与
2005年　ニューヨーク・ジャパン・ソサエティー文化芸術賞
2006年　国際美術評論家連盟ベスト展覧会賞

2001年　個展「召喚するかドアを開けるか回復するか全滅するか」／東京都現代美術館
2005年　グループ展「リトルボーイ」／ジャパン・ソサエティー・ギャラリー（ニューヨーク）
2007年　個展「村上隆回顧展Murakami ©」／ロサンゼルス現代美術館
※2008年 ブルックリン・ミュージアム（ニューヨーク）、ビルバオ・グッゲンハイム美術館など巡回

霧島アートの森（鹿児島）、金沢21世紀美術館、カルティエ現代美術財団（パリ）